Україна, будучи учасником міжурядових угод "Про взаємодію в галузі попередження і ліквідації наслідків надзвичайних ситуацій природного і техногенного характеру від 22.01.93" і "Про співробітництво і взаємодію в галузі вивчення землетрусів і прогнозування сейсмічної небезпеки від 24.09.93", у 1998 році значно активізувала свою роботу в Міждержавній раді з надзвичайних ситуацій природного і техногенного характеру (МДР з НС) щодо консолідації зусиль держав - учасниць СНД у галузі попередження і ліквідації надзвичайних ситуацій. Це дозволило МНС України стати одним із лідерів серед міністерств та інших органів виконавчої влади в галузі попередження і ліквідації НС СНД.
У липні 1998 року МНС України організувало і провело в м. Одесі 11-е засідання МДР з НС, вперше в СНД зустріч міністрів і керівників спеціально уповноважених органів виконавчої влади країн Співдружності, що вирішують завдання запобігання і ліквідації надзвичайних ситуацій. Це вимагало великої напруги в роботі МНС та інших державних органів України. Порядок денний зустрічі міністрів та інші документи були розроблені МНС України разом із Секретаріатом МДР з НС.
На зустрічі були обговорені концептуальні питання розвитку співробітництва в галузі попередження і ліквідації надзвичайних ситуацій держав-учасниць СНД і прийняті відповідні рішення, служать подальшому удосконаленню Міждержавної системи НС СНД. На зустрічі міністрів Україна однією з перших підтримала необхідність і доцільність створення в рамках Міждержавної системи НС Агентства з моніторингу і прогнозування надзвичайних ситуацій. При цьому МНС України проінформував учасників 11-го засідання МДР з НС про можливість використовувати в роботі Агентства фахівців України і деякі, наявні в МНС методики, що природно підвищує роль МНС України в забезпеченні функціонування Міждержавної системи НС СНД.
З 1998 році 10 слухачів України навчались в Академії цивільного захисту МНС Росії на безкоштовній основі відповідно до квоти, затвердженої Міждержавною радою з надзвичайних ситуацій.
У листопаді 1998 року Рада глав урядів СНД затвердила дві програми, розроблені МДР з НС: Міждержавна цільова програма розвитку Корпусу сил СНД для ліквідації наслідків надзвичайних ситуацій природного і техногенного характеру на період до 2010 року і Міждержавна науково-технічна програма створення сейсмологічного моніторингу територій держав учасниць СНД. В основу принципу фінансування обох програм покладені розробки МНС України, що дозволяють підвищити ефективність програм при зниженні фінансових витрат, а в програмі створення системи сейсмологічного моніторингу, крім того, використані оригінальні ідеї МНС України щодо оптимізації мережі сейсмічних пунктів спостережень.
Велика робота МНС України разом із науковими організаціями України, що працюють в галузі управління надзвичайними ситуаціями, проведена при підготовці до розгляду на 11-му засіданні МДР з НС Спільної програми наукових досліджень. Програма була схвалена на засіданні Міждержавної Ради в Одесі та подана в МЭК для розгляду у встановленому порядку. Багато наукових організацій України братимуть участь у спільних роботах із науковими організаціями Росії, Бєларусі й інших держав-учасниць СНД.
На зустрічі міністрів в Одесі була ретельно розглянута проблема Сарезького озера в Таджикистані. Головуючий на зустрічі призвав усі держави-учасниці СНД об'єднати зусилля в рішенні цієї проблеми, що загрожує катастрофою світового масштабу, а також рекомендував активізувати практичну роботу з залучення уваги світового співтовариства до даної проблеми. У даний час уже є практичні результати в напрямку рішення проблеми Сареза: проблема Сарезького озера розглянута на Колегії МЭК, де прийняте рішення про розробку міждержавної програми приведення Сарезького озера в безпечний стан.
За пропозицією України держави-учасниці СНД у вересні 1998 року направили в м. Єреван представницькі делегації на 5-у Міжнародну конференцію країн Центральної, Східної і Південно-Східної Європи з проблем захисту від природних та інших катастроф. Активна участь держав Співдружності в конференції дала можливість консолідувати зусилля багатьох держав Європи щодо продовження Магдебурзького процесу, що сприяє залученню уваги світового співтовариства до проблем захисту населення від природних та інших катастроф, а також обміну досвідом координації і взаємодопомоги держав у справі вирішення цих проблем. При цьому тверда позиція України на конференції що необхідності продовження Магдебурзького процесу дозволила включити до складу Робочої групи подальших подібних конференцій представника МДР з НС.
У жовтні 1998 року, при проведенні Генеральної Асамблеї МОЦО у м.Пекині, усі держави-учасники МДР з НС підтримали позицію України і Росії, спрямовану проти корпоративної політики деяких арабських держав у МОЦО. Така єдність поглядів держав-учасників МДР з НС буде мати вирішальне значення в подальшій роботі МОЦО.
У листопаді 1998 року МНС України направило до держав-учасниць СНД інформацію про паводкову ситуацію в Закарпатській області. Секретаріат МДР з НС у межах своєї компетенції вжив заходів по доведенню цієї інформації до державних органів НС держав Співдружності, Багато держав поінформували Секретаріат МДР з НС про надання в зв'язку з НС у Закарпатській області України гуманітарної допомоги (Бєларусь, Молдова, Росія і ін.), У 1999 році поглиблювалась і удосконалювалась робота з державами-учасницями СНД з питань попередження і ліквідації надзвичайних ситуацій.
Відповідно до доручення Кабінету Міністрів України від 31.03.99 №6264/8 МНС брало участь в обговоренні, внесенні змін і доповнень до проекту Конвенції про екологічну безпеку, подану Міждержавним економічним Комітетом. Міністерство взяло активну участь у ХІІ (Республіка Таджикистан, м. Душанбе, з 01 по 05 червня 1999 р.) та у ХІІІ (РФ, м. Красноярськ, з 17 по 19 листопада 1999 р.) засіданнях Міждержавної ради з надзвичайних ситуацій природного і техногенного характеру.
Важливість ХІІ та ХІІІ засідань полягала в тому, що була розглянута Програма діяльності країн СНД у 2000 році, пропозиції про внесення змін до персонального складу органу управління Корпусу Сил СНД та до Реєстру формувань, що виділяються до складу Корпусу Сил СНД від держав Співдружності, а також був затверджений склад Ради Агентства СНД з моніторингу і прогнозування НС.
Представники МНС поінформували присутніх про позицію України щодо внесення змін до складу Виконавчої дирекції Корпусу сил СНД і до реєстру формувань, що виділяються до складу Корпусу сил СНД. Із реєстру було виключено команду швидкого реагування "Кобра" (41 чол., 6 од. техніки), бригаду спеціалізованої медичної допомоги Українського центру "Медицина катастроф" (50 чол.), і внесено Центральний воєнізований аварійно-рятувальний загін (м. Київ, 165 чол.) та мобільний госпіталь МНС України (54 чол.).
На ХІІ та ХІІІ засіданнях МДР з НС був детально розглянутий перелік програмних заходів Міждержавної цільової програми розвитку корпусу сил СНД на період до 2010 року , внесені необхідні зміни і уточнення.
Щодо Агентства СНД із моніторингу і прогнозування надзвичайних ситуацій, позиція України залишилися незмінною і полягає у тому, щоб приймати у ньому участь в якості спостерігача, більш глибоко вивчити доцільність і необхідність його функціонування, не припускаючи дублювання завдань, покладених на Міждержавну раду.
На цей час МДР з НС перебуває у стадії організаційного реформування.
